Обычно это означает, что на компе появился еще один Старзовый клиент, в котором галки про сохранение файлов историй и саммари НЕ выставлены.
Проще всего от этого попапа избавиться, открыв тот клиент и поставив упомянутые галки вручную.
Изначально надо было не так делать:
а) не удалять папку с ненужным клиентом, а деинсталлировать клиент штатным образом. Потому что факт наличия на компе конкретного Старзового клиента ХМ выявляет, читая соотв. строку реестра Винды, а стереть ее из реестра может только штатный uninstall.
б) и помимо (а) еще и вручную удалить папку с рабочими фалами от этого ненужного клиента в %localappdata% - именно там ХМ обнаруживает файл конфигурации, в котором отсутствует настройка насчет сохранения историй.
А сейчас остается только исполнить (б) и посмотреть, поможет ли. Если нет - штатно поставить клиент заново, а потом выполнить и (а), и (б)